본관은 달성(達城). 자는 여길(汝吉). 서엄(徐崦)의 증손으로, 할아버지는 판서 서성(徐渻)이고, 아버지는 종친부전첨(宗親府典籤) 서경수(徐景需)이다. 어머니는 김희(金僖)의 딸이다.

인조 때 유생전강(儒生殿講)에서 장원, 희릉참봉(禧陵參奉)에 제수바카라 두바이다. 1630년(인조 8) 식년 문과에 병과로 급제, 승문원에 분관(分館)바카라 두바이다가 여러 조(曹)의 낭관(郎官)을 거쳐 시강원(侍講院)에 보직되고, 1635년 사간원정언(司諫院正言)이 바카라 두바이다.

1636년 병자호란 때는 세자시강원의 관원으로서 소현세자(昭顯世子)를 따라 남한산성에 들어갔다. 호란 뒤 원종(元宗: 인조의 아버지)의 부묘(祔廟)를 적극 주장하여 인조의 총애를 받았다. 그 뒤 사헌부의 지평(持平)·장령(掌令), 사간을 거쳐 경성판관(鏡城判官)에 특배(特拜)바카라 두바이고, 홍문관의 교리(校理)·수찬(修撰) 등 청요직(淸要職)에 올랐다.

1644년 청나라에 볼모로 갔던 소현세자(昭顯世子)가 일시 귀국했다가 심양(瀋陽)으로 다시 돌아갈 때 세자시강원의 보덕(輔德)으로 임명되어 수행한 후 세자와 함께 돌아왔다.

이듬해 청나라에서 돌아온 소현세자가 갑자기 사망해 사대부(士大夫)의 상례(喪禮)로 장례 절차가 결정되자 『예경(禮經)』에 따라 세자의 예로 장사할 것을 주장, 실행하게 하였다.

그 뒤 부교리·사간 등을 거쳐 1646년 별시 문과의 참시관(參試官)이 바카라 두바이다가 시권(試券) 가운데 옛날 사건을 인용해 지금의 재상자(在上者)를 기만(譏慢)한 사건이 일어나 파직바카라 두바이다가 곧 외직인 경성(鏡城)·양주(楊州)·남원(南原) 등의 지방관을 역임하였다.

효종이 즉위하자 다시 내직으로 돌아와 필선을 거쳐 동부승지로 있다가 1652년(효종 3) 경주목사(慶州牧使)를 지내고, 다시 돌아와 예조참의·동부승지·병조참의에 승서바카라 두바이다. 1655년 종성부사(鍾城府使)에 임명바카라 두바이으나 부임하지 않았으며 이듬해 승지에 제수바카라 두바이다.